濾油機/凈油機工作時，污染油液在外界大氣壓真空吸進的作用下經入口進入加熱器，加熱后的油液進入初濾器，大顆粒雜質被濾除，然后油液進入真空分離器，流過特制發散裝置。該發散裝置使單位體積的油液產生巨大的表面面積，讓污染油霧化，下落的油液曝露于相對濕度很低的氣氛中，從而瞬間蒸發油中的水分，清除油中的氣體和輕餾分。
濾油機/凈油機蒸發的水蒸汽、氣體、輕餾分所形成的混合氣體通過水箱和冷卻器冷凝成液體，一同進入儲水器，剩余的氣體被真空抽出。除去水分的油液經油泵輸入精濾器除去微粒雜質，即為凈化油，完成一個凈化過程，根據含水量的多少，須多次循環才能完全除去水分。
